Epigénétique, épidémiologie et traitement personnalisé des hémopathies malignes

Domaines d'expertise

Sur le plan fondamental et translationnel :

• Mécanismes cellulaires et moléculaires en particulier épigénétique de l’hématopoïèse et leurs rôles dans les cancers hématologiques (leucémies, lymphomes),
• Découverte, développement et validation de nouveaux (épi)biomarqueurs ou de cibles thérapeutiques en onco-hématologie (approches par hypothèse ou facteurs candidats ou en lien avec ‘l’exposome’),
• Bioinformatique oncologique (génétique somatique, (épi)génétique),
• (Épi)génomique fonctionnelle en onco-hématologie (CRISPR-Cas9).

Sur le plan épidémiologique et de recherche clinique :

• Épidémiologie clinique – études d’incidence, de survie et de qualité de vie en onco-hématologie en population générale,
• Recherche clinique – essais cliniques et études en biologie ancillaire autour de la maladie résiduelle moléculaire et métabolique et l’onco-(épi)génomique.

Axes de recherche

Notre recherche pluridisciplinaire vise l’identification de nouvelles stratégies de prévention, de diagnostic précoce et de traitement personnalisé de patients atteints de lymphomes ou de leucémies, ceci par une triple approche associant explorations épigénétique, épidémiologique et en recherche clinique.

• reprogrammation aberrante de l’hétérochromatine ; rôle dans la survenue (‘exposome’), évolution clonale et résistance thérapeutique dans les hémopathies malignes ; vers l’identification de nouvelles stratégies de prévention et de prise en charge des patients
• études de ‘vie réelle’ sur l’impact des innovations diagnostiques et thérapeutiques sur la survie, la guérison et la qualité de vie de patients atteints d’hémopathies malignes
• recherche clinique autour de nouvelles stratégies thérapeutiques et de suivi dynamique des patients atteints de lymphomes agressifs [approches intégrées cliniques, maladie résiduelle moléculaire / métabolique, (épi)-biomarqueurs et de modélisation mathématique]

Exemples de Réalisations

• Le Gouill S, Morschhauser F, Chiron D, Bouabdallah K, Cartron G, Casasnovas O, Bodet-Milin C, Ragot S, Bossard C, Nadal N, Herbaux C, Tessoulin B, Tchernonog E, Rossi C, McCulloch R, Gastinne T, Callanan MB*, Rule S*. Ibrutinib, obinutuzumab, and venetoclax in relapsed and untreated patients with mantle cell lymphoma: a phase 1/2 trial. Blood. 2021 Feb 18;137(7):877-887. doi: 10.1182/blood.2020008727. PMID: 33181832.*equal contribution
• Burlet B, Ramla S, Fournier C, Abrey-Recalde MJ, Sauter C, Chrétien ML, Rossi C, Duffourd Y, Ragot S, Buriller C, Tournier B, Chapusot C, Nadal N, Racine J, Guy J, Bailly F, Martin L, Casasnovas O, Bastie JN, Caillot D, Albuisson J, Broccardo C, Thieblemont C, Delva L, Maynadié M, Aucagne R, Callanan MB. Identification of novel, clonally stable, somatic mutations targeting transcription factors PAX5 and NKX2-3, the epigenetic regulator LRIF1, and BRAF in a case of atypical B-cell chronic lymphocytic leukemia harboring a t(14;18)(q32;q21). Cold Spring Harb Mol Case Stud. 2021 Feb 19;7(1):a005934. doi: 10.1101/mcs.a005934. PMID: 33608382; PMCID: PMC7903887.
• Klibi J, Joseph C, Delord M, Teissandier A, Lucas B, Chomienne C, Toubert A, Bourc'his D, Guidez F*, Benlagha K*. PLZF Acetylation Levels Regulate NKT Cell Differentiation. J Immunol. 2021 Aug 1;207(3):809-823. doi: 10.4049/jimmunol.2001444. Epub 2021 Jul 19. PMID: 34282003. *co-corresponding
• Mounier M, Romain G, Callanan M, Alla AD, Boussari O, Maynadié M, Colonna M, Jooste V. Flexible Modeling of Net Survival and Cure by AML Subtype and Age: A French Population-Based Study from FRANCIM. J Clin Med. 2021 Apr 13;10(8):1657. doi: 10.3390/jcm10081657. PMID: 33924506; PMCID: PMC8069423.
• Hermetet F, Buffière A, Aznague A, Pais de Barros JP, Bastie JN, Delva L, Quéré R. High-fat diet disturbs lipid raft/TGF-β signaling-mediated maintenance of hematopoietic stem cells in mouse bone marrow. Nat Commun. 2019 Jan 31;10(1):523. doi: 10.1038/s41467-018-08228-0. PMID: 30705272; PMCID : PMC6355776.

En complèment

Mots-clés complémentaires : cancers du sang – cellules souches hématopoïétiques – chromatine – régulation épigénétique dépendante des ARN - thérapies anticancéreuses – immunothérapies – Ct DNA