Plateforme de Transfert en Biologie du Cancer

Compétences techniques

• Immunomonitoring périphérique et tumoral des populations immunitaires murines et humaines,
• Analyse de la réponse T spécifique murine et humaine par ELISPOT,
• Analyse de l’expression génique murine et humaine par la technique NANOSTRING,
• Etude tissulaire par immunohistochimie ou immunofluorescence,
• Modélisation pré-clinique de traitements chimio-immuno thérapeutiques,
• Biostatistiques/Bioinformatiques.

Domaines d'application

Oncologie, Immunologie, Médecine personnalisée

Analyses et équipements

Analyse tissulaire des populations tumorales, immunitaires murines et humaines

• Coloration
• Immunohistochimie et immunofluorescence
• Numérisation et analyse des lames via QuPath, par intelligence artificielle
• Equipements à disposition :
  • Microtome Sakura associé à une station de refroidissement des blocs Arcadia C (Leica)
  • Automate de marquages de lames : Autostainer Link 48 (associé à une station de déparaffinage et démasquage PT LINK PT200)
  • Scanners de lames : Nanozoomer HT2.0 (Hamammatsu) & SLIDEVIEW VS200 (Evident)
  • Microscope spectral (Perkin Elmer) : Mantra associé à la pla teforme d’analyse Inform

Analyse périphérique et tumorale des populations immunitaires murines et humaines

• Récupération et dissociation de tumeurs murines et humaines
• Analyse périphérique (sang, PBMC) et tumorale des populations immunitaires
• Analyse de la sécrétion des cytokines relarguées (ELISA, Bioplex)
• Equipements à disposition :
  • Dissociateur de tissus : GentleMACS (Miltenyi Biotec)
  • Système de séparateur cellulaire : MultiMACS Cell 24 Separator Plus (Miltenyi Biotec)
  • Cytomètre en flux CytoFLEX (13 détecteurs/3 lasers) (Beckman Coulter)
  • Cytomètre en flux clinique DxFLEX (Beckman Coulter)
  • Cytomètre spectral Aurora (5 lasers) (Cytek)

Analyse de la réponse T spécifique murine et humaine par ELISPOT

• Culture et expansion de PBMC ou leucocytes murins ex vivo en présence d’antigènes (conservés ou néo-antigènes)
• Analyse de la réponse IFNγ (ou autre cytokine) spécifique de l’antigène utilisée
• Equipement à disposition :
  • Lecteur de plaques ELISPOT : Immunospot S6 Alfa (Immunospot)

Analyse de l’expression génique murine et humaine

• Extraction et qualification des ARN
• Analyse de l’expression génique par RT-qPCR ou avec la technique Nanostring
• Equipements à disposition :
  • Systèmes de PCR en temps réel QuantStudio 5 (ThermoFisher) et Aria MX (Agilent)
  • Système d’analyse nCounter (Nanostring)

Exemples de réalisations

• Etude des effets d’une chimiothérapie associée à une immunothérapie dans un modèle de cancer colique murin (prestation de recherche). Le but de cette étude était d’identifier les effets sur le système immunitaire d’une chimiothérapie du laboratoire demandeur et de démontrer l’efficacité d’une combinaison de cette chimiothérapie avec une immunothérapie anti-PD1.
• Etude des effets d’une double immunothérapie sur des cellules de patients atteints de cancer du côlon sur une demande de la société (Roche/Genentech). Nous avions pour objectif de tester l’effet de deux immunothérapies, seules ou combinées, sur les lymphocytes périphériques ou intra-tumoraux et de mettre en évidence si ces 2 molécules étaient capables de réactiver le système immunitaire en induisant une augmentation de la prolifération et/ou de la cytotoxicité de ces cellules.
• Immunomonitoring sanguin de patients inclus dans un essai clinique testant une double chimiothérapie associée à une double immunothérapie. Le but a été d’étudier le système immunitaire de patients atteints de cancer du côlon métastatique avant et pendant le traitement pour tenter de mettre en évidence les profils de réponse ou de non réponse au traitement donné.