Ecologie Microbienne Fonctionnelle et Evolutive pour des Ecosystèmes Durables

Domaines d'expertise

Ecologie des communautés microbiennes dans les sols en relation avec le fonctionnement des agroécosystèmes et le devenir des intrants chimiques et biologiques d’origine agricoles.

Axes de recherche

• Compréhension du rôle de la biodiversité, des interactions abiotiques et biotiques, y compris les interactions entre les macro-organismes (plantes et faune) et les micro-organismes, dans les services écosystémiques des sols;
• Suivi et évaluation et de l'impact des stratégies de gestion des agro-écosystèmes sur les communautés microbiennes du sol et les fonctions des sols associées, afin de promouvoir la multifonctionnalité des écosystèmes ;
• Compréhension du rôle des communautés microbiennes fonctionnelles dans la régulation du cycle de l’azote, les émissions d’oxyde d’azote (gaz à effet de serre), et la biodégradation des polluants organiques dont les pesticides ;
• Etude de procédés d’ingénierie écologique pour améliorer la durabilité des agro-écosystèmes, par exemple via la sélection artificielle de communautés microbiennes supportant des fonctions écosystémiques.

Exemples de Réalisations

• Projet H2020 EU project, Marie Curie ETN ARISTO (Research and Training Network fOr AdVanced Assessment of the EcoToxicity of Pesticides on Soil Microbes in Europe
• Projet ANR COMICONS: Comammox Microorganisms' Contribution to Nitrification in Soil, ANR projet générique
• Projet ANR IMMINENT :IMproving Microbial Inoculation based on Ecological Niche Theory–From theory to practice
• Projet IMPACT CE : Développement et transfert aux opérationnels d’outils intégratifs de mesure chimique et biologique au sein des cours d’eau pour le suivi de l’impact des pratiques agricoles et de leur l’évolution (OFB, partenaire).
• Projet Antibiotool : Des outils pour caractériser et suivre les antibiotiques et antibiorésistances dans les écosystèmes aquatiques (ANSES, partenaire).
• Projet ANR Antibiotox Dynamique des antibiotiques et des gènes de résistance associés dans les agrosystèmes : risques écotoxicologiques pour les communautés microbiennes des systèmes lotiques receveurs (ANR, coordination, PRCE)
• Projet ANR DECISIVE : Démonstration de la dégradation des polluants du sol avec l’analyse isotopique spécifique au composé multi-élémentaire (ANR, projet générique, partenaire).
• Projet AWARE : Evaluation du devenir des pesticides et des contaminants des eaux usées en cultures

En complèment

Equipe BIOmE/EMFEED