Microbiologie Environnementale et Risque Sanitaire

Domaines d'expertise

• Etude des risques infectieux pour la santé animale et humaine d’origine environnementale (Approche One Health) ; Étude de la circulation et de l’adaptation des microorganismes potentiellement pathogènes entre les environnements abiotiques et les hôtes animaux ou humains et végétaux, impact des paramètres environnementaux (sols, eaux).
• Ingénierie écologique : inoculation microbienne, adaptation au stress osmotique et physiologie des bactéries dans ces conditions.

Axes de recherche

• Etude de la propagation d'agents pathogènes humains et de micro-organismes résistants aux antibiotiques dans les agro-écosystèmes (sols et eaux), microbiologie environnementale.
  • Etude des mécanismes d’adaptation de microorganismes modèles au niveau de l’environnement abiotique et de tissus végétaux
  • Gestion des risques associés à la propagation de souches résistantes aux antibiotiques et de leurs gènes dans l’environnement sol en lien avec le recyclage de déchets organiques (fumiers, boues, digestats).
• Ecologie et l'ingénierie écologique : Inoculation microbienne -compréhension de l’adaptation au stress osmotique
• Contribution au développement de bioindicateurs pour surveiller l'impact de la contamination et des pratiques de gestion sur les populations microbiennes.

Exemples de Réalisations

• Présence et survie de bactéries résistantes aux antibiotiques et de pathogènes ré émergents (bactéries productrices de bêta-lactamase à spectre étendu (BLSE) et de Mycobacterium bovis) dans le sol. Développement de méthodologies innovantes de détection électrochimique en collaboration avec l'industrie et les acteurs de l'agriculture;
• Facteurs affectant la survie de Listeria monocytogenes dans les agro-écosystèmes, détermination des facteurs abiotiques et biotiques spécifiques du sol, importants pour la survie de Listeria. Découverte de la communication de cellule à cellule en tant que facteur important pour la survie de Listeria, même à des densités de cellules «faibles»
• Isolement et caractérisation de souches de Klebsiella pneumoniae d’origine environnementale
• Brevet sur la détection électrochimique de bactéries productrices de beta lactamase à spectre élargi (BLSE)
• Contrats de licence de savoir faire pour la production d’inoculants