Ensemble de Ressources Biologiques

Compétences techniques

Gestion de collections d’adventices, de légumineuses à grosses graines, de Mycorhizes à Arbuscule (AM), et Microorganismes d'Intérêt pour l'Agriculture et l'Environnement avec pour objectifs :

• La préservation de la diversité des organismes
• L’amélioration des outils d'identification et de caractérisation
• L’organisation de bases de données permettant d'associer les traits taxonomiques et écologiques des organismes
• La fourniture de matériel biologique d’excellente qualité à des chercheurs

Domaines d'application

environnement, agriculture, ONF, industries alimentaires, alimentation animale

Analyses et équipements

Collection de semences adventices

• Maintien d’un ensemble de lots de semences pour des différents objectifs scientifiques 
• Identification de plantes/plantules/semences (à l’aide notamment d’une carpothèque d’environ 800 taxons répartis en plus de 60 familles botaniques)

Collection de Légumineuses à grosses graines (principalement le pois (Pisum spp. ), la féverole (Vicia faba) et le lupin (Lupinus spp.))

• Caractérisation génétique et phénotypique permettant la définition de collections de référence et le développement de stratégies de génétique d'association.

11000 adhésions y compris des variétés, des mutants et des formes sauvages.

Collection de Mycorhizes à Arbuscule (AM)

• Réservoir de base du matériel génétique de la diversité fongique sur les plantes hôtes (45 isolats / 250 cultures)
• Fourniture de cultures de référence aux chercheurs, contrats de commercialisation avec des industriels
• Développement de sondes moléculaires

Collection de Microorganismes d'Intérêt pour l'Agriculture et l'Environnement

• Réservoir de base du matériel génétique de la diversité microbienne d'environnements agricoles
  (15 000 souches microbiennes d'origine tellurique appartenant à 48 genres de champignons et oomycètes et 13 genres de bactéries)
• Fourniture de cultures de référence aux chercheurs, contrats de commercialisation avec des industriels
• Identification fongique et bactérienne basée sur les propriétés chimiotaxonomiques et / ou métaboliques

Exemples de réalisations

• Burstin J, Salloignon P, Chabert-Martinello M, Magnin-Robert J-B, Siol M, Jacquin F, Chauveau A, Pont C, Aubert G, Delaitre C, Truntzer C, Duc G. 2015. Genetic diversity and trait genomic prediction in a pea diversity panel. BMC Genomics. 16:74–17, doi:10.1186/s12864-015-1266-1.
• Crossay T, Antheaume, C, Redecker D, Bon L, Chedri N, Richert C, Guentas L, Cavaloc Y, Amir H. 2017. New method for the identification of arbuscular mycorrhizal fungi by proteomic-based biotyping of spores using MALDI-TOF-MS. Scientific Reports 7: 14306. doi:10.1038/s41598-017-14487-6
• Matejicek A, Felten E, Pimet E, Reibel C, Sarrasin C, Vieren E, Moreau D, Chauvel B (2018). Prenez-en de la graine ! Bourgogne Nature 27 : 18-22.
• Merlin C, Devers M, Crouzet O, Heraud C, Steinberg C, Mougin C, Martin-Laurent F. 2013. Characterization of chlordecone-tolerant fungal populations isolated from long-term polluted tropical volcanic soil in the French West Indies. Environ Sci Pollut Res. 21:4914–4927, doi:10.1007/s11356-013-1971-8.
• Reibel C, Chauvel B, Felten E, Gounon R, Laurent E, Matejicek A, Pimet E, Vieren E, Moreau D (sous presse). Mieux connaître la diversité des semences adventices. Phytoma.
• Burstin J, Salloignon P, Chabert-Martinello M, Magnin-Robert J-B, Siol M, Jacquin F, Chauveau A, Pont C, Aubert G, Delaitre C, Truntzer C, Duc G. 2015. Genetic diversity and trait genomic prediction in a pea diversity panel. BMC Genomics. 16:74–17, doi:10.1186/s12864-015-1266-1.